Benjamin NemozM.D., Ph.D.
Médecin-chercheur · ingénierie des anticorps, immunologie structurale & apprentissage automatique
Je développe les modèles qui conçoivent les anticorps, fort d'une décennie passée à la paillasse et en clinique. Mon travail va de la découverte d'anticorps largement neutralisants et du séquençage de répertoires à haut débit jusqu'aux modèles de fondation d'anticorps, à la modélisation de l'hypermutation somatique et à l'outillage agentique qui les entoure.
Paillasse
Découverte d'anticorps largement neutralisants, trimères SOSIP, BLI et séquençage de répertoires nativement appariés à haut débit, au Scripps Research Institute.
Clinique
Virologue médical ; responsable de la réponse aux pathogènes émergents et d'un laboratoire NSB-3 (BSL-3) pendant la pandémie. Premier auteur d'une observation clinique dans le NEJM.
Code
Modèles de fondation d'anticorps et d'hypermutation somatique, prédiction d'affinité et systèmes agentiques. Cofondateur / directeur technique d'une entreprise de conception d'anticorps par IA.
Publications choisies
Liste complète sur Google Scholar — 519 citations, indice h 11.
Projets
Un modèle de fondation d'anticorps au niveau nucléotidique (AbLM) et un modèle d'hypermutation somatique (SHM) qui capturent l'évolution du répertoire des lymphocytes B. Une SHM simulée par IA, indépendante de l'antigène, a amélioré jusqu'à 76 fois la puissance neutralisante d'anticorps largement neutralisants du VIH-1 (poster).
Une plateforme à haut débit pour le séquençage de répertoires d'anticorps nativement appariés : code-barres combinatoire à l'échelle de millions de paires lourde/légère.
À partir du donneur neutraliseur d'élite du VIH-1 PC94, isolement et caractérisation de bout en bout de la lignée largement neutralisante PC94-A (neutralisation, BLI, cryo-EM), avec maturation guidée par le modèle et une étude IgA.
Modèles de prédiction d'affinité de liaison, comparant approches quantiques et classiques.
Société
Conception semi-autonome d'anticorps monoclonaux thérapeutiques entièrement humains de nouvelle génération. Autofinancée ; programmes avec le DKFZ et une biotech cotée au NASDAQ ; lauréate du label national français « Deep Tech » (Bpifrance).